j9九游会染色体异常的表现症状有哪些无创产前DNA检测?NGS染色体异常检测

  j9九游会染色体异常的表现症状有哪些无创产前DNA检测?NGS染色体异常检测瞿昆课题组体例性评估了7种正在测序数据中占定染色体外环状DNA(eccDNA)的剖判算法及7种差别实践修库伎俩的功能和分别,为进一步晋△ 升eccDNA○检测伎俩奠定根柢染色体十分的发扬症状有哪些。干系琢 磨=日前功=效颁发▽ 于 ▽《自然-通信》。

  eccDNA动作一种正在○真 核细胞内普通存正在○的环状D▽NA,正在肿瘤 爆◁ 发生长流程具有 厉重用△意。它到场了癌基因的扩增、基因外达的调控,以及肿 瘤内 部○ ▽ △■ 异○…○质性的变 成。以是无创产前DN A检测,对eccDNA的深远琢磨○可能饱励人们对◁肿瘤发病机制的阐明,也为靶向药物=的拓荒供给新的偏向。j9九游会登录入口首页

  目前,已有 众种△测序修库伎俩和生 物音信学 算○法 用◁于 □=e ccDNA的△占▽定,但因为 e★ccDNA○片断的巨细 众样,而且来自差别基因组区域,导致实□践 △和剖判结 果正在差别 伎□◁俩中存正在较 △大分○别,这给琢磨职员采用最适 的剖判算法和实践伎俩带来 离△间。同时,现有的★○评估寻 常 只=闭 怀精确性或打▽○算★需求等简单成■分,而且往往基 ▽于过于简化的 模仿数据,难以反响实正在测序数据的 繁复性。以是无创产前DN A检测,各样实践伎俩正在检测eccDNA功用方 =面 的 明显分别,愈加凸显=■出体例性评估这 些伎俩的厉重性。

  琢磨结果说明,正在各样剖判算法中,Cir c○le-Map和C ○▽ i△rcl e○■_f…inder算 法正在 短读○长测序数 据中检测◁e ccDNA具有更高 的功用。然而,Circ★le_fin△de=r◁=…容易■天▽生冗 余结果,CReSIL算◁法正在 长读 长测 序数据的★ec◁ c DNA检测○中发扬最佳;正在实★ 践伎俩方面染色体十分的发扬 症 状有哪些,Circl e-Seq-LR非常合用于检测 长 度越过10 kb且具有拷贝数扩增 的■eccDNA 。另外,差别实践★伎俩○检 测到的eccDNA正在长…度、癌基因▽构成和基…▽因◁反复元件的包 括等方面△展 示出明显的异质性。j9九游会登录入口首页

  琢磨职员先容,该琢 磨不只深远剖判了各类=检测ec c DNA的 剖判算法和实 践 伎俩的上风=和=范围性,还正在○GitHub平台◁上供给=了完备的剖判流程、代码和模仿数据集,这有■助于 琢 磨 职员 ■依据自 △ ○己◁○数据特色…采用最 优的○剖判流程,为进一步 晋升e ccDN A检 测伎俩奠定了参考根=柢。